Moro fu chiamato alle armi nel luglio 1941 e, dopo l’addestramento, fu assegnato al tribunale militare di Bari col grado di sergente, potendo così mantenere rapporti con l’università e il mondo cattolico. Capitano di complemento dell’Aeronautica dal giugno 1943, il crollo del fascismo lo colse ancora presso il tribunale militare di Bari. Dopo la Liberazione, in una linea di collaborazione tra il neo costituito governo del Sud e l’autorità militare alleata, svolse alcune conversazioni trasmesse da Radio Bari. Inoltre fondò e diresse un settimanale, La Rassegna (novembre 1943 - marzo 1945), rivista politica di ambito non solo regionale che ebbe il ruolo di orientare nella nuova Italia settori dell’opinione pubblica meridionale.